高校网站安全管理，应从源头开始，在其生命周期内，开展全方位、多维度的体系化防护。首先，应梳理出所有的在线网站，明确其基本信息和管理归属并进行备案登记；其次，按照安全管理制度对其执行上线管理、运行管控以及退出机制。
完善网站安全管理制度，有利于规范、制约和协调网站安全管理。网站与应用系统在生命周期内各个时期对安全管理的要求不同，因此在制定网站安全管理制度时，应依据建设、备案、上线、运行与维护、退出等各阶段，制定相应的管理制度。如网站安全建设规范、网站备案登记制度、网站安全上线管理制度、网站安全运行制度，网站安全维护制度、网站退出归档制度等。所有的制度规范应由信息安全小组起草并由学校审批发布。网站安全管理制度应明确组织职责，且具有可操作性，其实施、运作应贯穿于网站和应用系统的全生命周期中。