下文中将具体讲述处理的方法：
1.使用Mysql 4.0或4.1版本，如果没有用到Mysql 5的一些新特性比如存储过程触发器之类。
2.定时重启Mysql服务器或Ser（由于本问题可能同样会影响到其它一些需要Mysql支持的服务器程序，所以重启Mysql服务器为好，但需要检测Mysql服务器不被使用的一个时间重启比较难确定）
3.设置my.cnf，有mysqld字段内增加参数：
[mysqld]port = 3306socket = /tmp/mysql.sockwait_timeout= 500000interactive_timeout = 500000（500000秒约五六天的超时时间，可根据实际需要选择一个数据库可能空闲的最长时间稍大的时间值。）重启Mysqld应用即可，也可以在执行mysqld时加-o wait_timeout=500000参数同样效果。
在MySQL客户端show variable时应该可以看到最后一条从默认的wait_time=28000变成500000了。
注：假如重启Mysqld不生效，可以重启机子。